虽然联合国己经退回台湾入联申请书，陈水扁再度致函联合国秘书长潘基文表达台湾申请入联的决心。
另一方面，陈水扁和台湾外交部都强调申请入联不涉及更改国号的问题。
台湾外交部星期一(30日)召开记者会宣读给潘基文的公开信，内容指出联合国秘书处退回台湾入联申请书是明显逾权。
因为联合国2758号决议并未赋予中国在联合国代表台湾2.3千万人民的权利，更没有提到台湾是中国的一部份。
台湾外交部长黄志芳表示，总统陈水扁在星期六(27日)再度致函联合国秘书长潘基文与中国驻联合国常任代表王光亚，表达台湾申请加入联合国决心。
此前陈水扁以台湾总统身分致函给联合国秘书长潘基文，提出以台湾名义申请加入联合国。
联合国错误解读
黄志芳表示，再度致函不是为了挑衅中国，也不是办法理台独，只是针对联合国秘书处错误解读2758号决议。
他说有关解读“不仅不合理、不合法、更不符合东亚的现状，尤其不能构成联合国秘书处退件的法理，恐怕也不符合很多国家对两岸关系的认知。
”
联合国不接受由两个会员国提出的台湾加入联合国的申请，已在上周二(24日)将申请书退回。
联合国法律事务厅指出，将申请书退回是基于联大2758号决议，这一决议确定了联合国奉行一个中国的政策。
没有违反四不
另一方面，美国国务院官员较早前指出，陈水扁推动以台湾名义申请加入联合国案是违返了先前“四不”承诺中“不会更改国号”的承诺。
但陈水扁星期天(29日)在一个公开场合回应说：“在国际上，中华民国不能用也不能改，人家可以叫我们台湾，反而我们不能称自己是台湾。
以台澎金马特别关税领域名义加入ＷＨＯ(世界卫生组织)不是改变国号，以台湾名义申请加入联合国却被解读为国号的变更。
”
黄志芳也重申，申请入联和改变现状、变更国号没有关系。
他表示，美国从来都不支持台湾加入联合国，而在美国这次的公开表态后，外交部已经多次和美国进行密切沟通，希望美国方面能够正视台湾民众希望以台湾名义加入联合国的声音。
