据香港《文汇报》4日报道，法航失事原因仍扑朔迷离，有法航前机师指失事客机可能与军机或运毒飞机相撞后坠毁，法国当局预计本月底会完成初步调查报告。
法国航空安全调查部门主管阿尔斯拉尼安3日称，初步调查报告预计本月底完成，至今无迹象显示客机起飞前出现故障，调查员正研究该机的维修和其它纪录。对于有揣测指机长事发时可能不在驾驶舱，阿尔斯拉尼安表示不肯定客机坠毁时，机长是否正在控制飞机。
法航客机因何坠毁人言人殊，法航前机师马尼耶表示，客机可能撞中军机或毒贩用作运毒的飞机。他说：“任何事都可能发生，可能与另一飞机相撞，可能是一架军机或一架运毒飞机。若是后者，当然无人会报称失踪。”
天气因素依然是调查重点，有航空专家集中研究猛烈风暴肇祸的可能性，指客机当时正迎着时速160公里强风逆风而行。
世界气象组织(WMO)航空气象主任普姆培尔表示，天气可能是失事的一个原因，但极不可能是唯一原因，他强调“人为因素也很重要”，指出在飞越飞行黑点时，机师会承受较大压力。
两名退休机师接受媒体访问时称，虽然先进的飞机能抵受雷击，但机师一般都避免驶进风暴里，其中一位退休机师更曾为避开大西洋西部一个风暴而绕道近300海里。
