陈水扁两任台湾总统任内究竟坐拥多少钱？特侦组表示，他八年任内至少掌握40亿元资金，包括汇往瑞士的7亿元、国泰世华保管室8亿元，加上他坦承各项选举募款20亿元、两任总统选举补助款3.4亿元及国务机要费等不法所得2亿元。
陈水扁24日在法庭上强调，前中信金控副董事长辜仲谅曾经给扁家2.9亿政治献金，其中2亿元是2004年3月中直接给吴淑珍，他因忙于台湾总统大选，直到检察官去年底告知他，他才知悉。至于其余分别用在2002年台北高雄两市市长选举2000万元、2004年立委选举5000万元、罗文嘉竞选台北县长1500万元，来源及流向都能清楚交代。
不过，特侦组检察官林嚞慧则对扁提出质疑，扁辩称辜仲谅2.9亿为政治献金，但扁在去年8月15日侦查庭则供称，两任总统选举补助款共有3.4亿元，除了吴淑珍拿走外，剩下的全用在民进党立委选举，以致于谢长廷在竞选总统时，无法提供金援。
林嚞慧表示，扁也坦承过去选举共募了20亿元，若以此来推论，加上扁家在瑞士的2000多万美金、约台币7亿元及国泰世华保管室8亿元，总计扁任内共握有至少40多亿元的资金，扁全推说是政治献金，但却未还诸于社会。
林嚞慧说，扁八年任内薪水4000万元全部信托，却在2005年8月10日，由陈镇慧支付以扁为被保险人的国泰人寿保费170万元，钱从何而来？
另外，在吴淑珍指示杜丽萍等人到国泰世华保管室搬钱前，扁在2006年6月间，便要求蔡镇宇到官邸，请蔡协助处理保管室的现金，为何不将所谓的政治献金用在民进党选举之用？
